Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zfp444Q3TDV8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zfp444Q3TDV8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms