Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tmem248Q3TBN1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem248Q3TBN1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms