Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cpne7Q0VE82 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms