Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Spata18Q0P557 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Spata18Q0P557 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms