Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Calb2Q08331 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms