Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad51Q08297 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms