Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnn2Q08093 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms