Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnn1Q08091 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms