Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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F13bQ07968 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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F13bQ07968 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
F13bQ07968 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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F13bQ07968 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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