Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pou6f1Q07916 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms