Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a2Q07643 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Col9a2Q07643 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms