Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aplp2Q06335 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aplp2Q06335 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms