Protein–RNA interactions for Protein: Q05306

Col10a1, Collagen alpha-1(X) chain, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col10a1Q05306 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Col10a1Q05306 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms