Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox13Q04891 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox13Q04891 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms