Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sox8Q04886 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sox8Q04886 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms