Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smarcad1Q04692 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Smarcad1Q04692 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms