Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp11Q02853 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp11Q02853 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms