Protein–RNA interactions for Protein: Q02614

Sap30bp, SAP30-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30bpQ02614 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sap30bpQ02614 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sap30bpQ02614 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms