Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VcpQ01853 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms