Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms