Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Col1a2Q01149 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Col1a2Q01149 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms