Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms