Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VldlrP98156 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VldlrP98156 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms