Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Shc1P98083 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Shc1P98083 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms