Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf1aP97357 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms