Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vgll3P85442 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vgll3P85442 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms