Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms