Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms