Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkn1P70268 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms