Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Hoxd13P70217 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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Hoxd13P70217 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Hoxd13P70217 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Hoxd13P70217 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Hoxd13P70217 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Hoxd13P70217 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxd13P70217 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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