Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Traf6P70196 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Traf6P70196 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms