Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtnP63089 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtnP63089 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtnP63089 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PtnP63089 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PtnP63089 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PtnP63089 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PtnP63089 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtnP63089 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PtnP63089 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms