Protein–RNA interactions for Protein: P62500

Tsc22d1, TSC22 domain family protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d1P62500 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tsc22d1P62500 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tsc22d1P62500 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms