Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vbp1P61759 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vbp1P61759 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vbp1P61759 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vbp1P61759 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vbp1P61759 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vbp1P61759 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vbp1P61759 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vbp1P61759 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vbp1P61759 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vbp1P61759 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vbp1P61759 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Vbp1P61759 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Vbp1P61759 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Vbp1P61759 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vbp1P61759 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Vbp1P61759 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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