Protein–RNA interactions for Protein: P61205

Arf3, ADP-ribosylation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf3P61205 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arf3P61205 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms