Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ube2kP61087 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2kP61087 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms