Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ube2d1P61080 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ube2d1P61080 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms