Protein–RNA interactions for Protein: P61022

Chp1, Calcineurin B homologous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp1P61022 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chp1P61022 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Chp1P61022 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms