Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
P58686 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
P58686 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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P58686 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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P58686 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
P58686 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
P58686 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms