Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gp1bbP56400 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gp1bbP56400 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms