Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab8aP55258 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab8aP55258 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms