Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bp1P55194 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms