Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CtskP55097 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CtskP55097 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtskP55097 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtskP55097 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtskP55097 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CtskP55097 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CtskP55097 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CtskP55097 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms