Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Faf1P54731 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Faf1P54731 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms