Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad23aP54726 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rad23aP54726 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms