Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RabggtbP53612 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RabggtbP53612 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms