Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ClgnP52194 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClgnP52194 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ClgnP52194 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms