Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lhx3P50481 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lhx3P50481 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms