Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Epb42P49222 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Epb42P49222 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms