Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VdrP48281 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VdrP48281 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VdrP48281 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VdrP48281 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VdrP48281 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VdrP48281 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VdrP48281 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms